lundi 30 septembre 2019

L'actualité scientifique de Jacques en août 2019

01.08.2019 Nature 572,7767
-11. This week.

CLIMAT, TEMPÉRATURE, RECORD, EUROPE, INDE. Tous

Double série de records de température en Europe en moins d'un mois. 38,7°C en Angleterre, 46°C en France (record battu de 1,9°, bravo !). Tout ça, de la rigolade à côté des plus de 50° pendant plusieurs semaines le mois passé en Inde et les 55° mesurés au Kuwait et au Pakistan l'an passé (3e plus haute température officiellement mesurée). Bravo aussi !

-15, Heidi Ledford, News

INGENIERING GÉNÉTIQUE, CRISPPR, RÉGULATION UE, Les biologistes.
OGM : on n'est pas hors de l'auberge.


Dans la Communauté européenne, tous les produits de consommation génétiquement modifiés sont soumis à une réglementation bien plus sévère que les produits non génétiquement modifiés. Jusqu'ici, il était relativement facile de distinguer un OGM d'un organisme produit par les méthodes standard de sélection parce que les manipulations impliquaient de relativement gros morceaux d'ADN transférés ou modifiés. Ils étaient vite et précisément détectés par les méthodes standard d'amplifications des fragments d'ADN.
Avec CRISPR, tout change. Il se peut, par exemple, que le nouvel organisme soit obtenu en changeant une seule base (une lettre de l'ADN), juste au bon endroit. Comment savoir ce qui a été changé parmi les mutations naturelles qui arrivent, comme ça, par hasard ? On ne le verra que si on sait où regarder. Les firmes ne sont pas prêtes à communiquer leurs petits secrets.
Les Américains ont trouvé leur solution. Les « OGM » obtenus par modifications génétiques ciblées grâce à CISPR, ou avec des outils semblables, ne sont pas des OGM. Les Européens restent à la définition classique et ne savent plus comment faire.
Nous avons déjà discuté l'arrivée prévisible de ce problème. La solution consisterait à ne pas se préoccuper de la façon par laquelle la modification est obtenue, mais seulement de ce qui est obtenu.

Ledford, H. (2019). CRISPR conundrum: Strict European court ruling leaves food-testing labs without a plan. Nature, 572(7767), 15. Retrieved from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31363192. doi:10.1038/d41586-019-02162-x

-35-36 (commentaire), 51 – 55, Toll et coll.

CLIMAT, POLLUTION, AEROSOL, NUAGE, EAU, RÉFLECTANCE, GEOINGENIERING. .  Com sci. GPclim, un peu indigeste. Ernst Zürcher qui décrit l'augmentation de la couverture nuageuse au-dessus des forêts pourrait être intéressé.

L'effet de la pollution sur la réflectivité des nuages ; nombre et dimensions des gouttes d'eau.
Les microparticules de la pollution favorisent la formation des gouttes d'eau. De ce fait, la dimension des gouttes dans un nuage pollué est plus petite que dans un nuage propre. Conséquemment, la réflectance est plus élevée; le flux solaire est mieux renvoyé dans l'espace. Ainsi fonctionne l'effet refroidisseur de la pollution. On dit que, sans cet effet, l'échauffement climatique actuel de 0,9°C serait de 1,1 ou 1,2°C. Les géoingénieurs aiment ça. Ils imaginent un bel avenir pour lur profession. Nous, nous n'aimons pas.
Autre phénomène découvert et documenté dans le cadre de cette étude (mais non expliqué), la concentration en vapeur d'eau est plus petite dans une plume de pollution (typiquement dans le nuage de microparticules issu d'une centrale thermique) que dans l'air non pollué. 
Les deux phénomènes (dimension des gouttes et concentration de vapeur d'eau) ont un effet opposé sur la réflectance. Comment se compensent-ils ?
La réponse donnée ici est que la réflectance est d'abord déterminée par la dimension des gouttes. Son augmentation par la pollution n'est compensée que pour 1/4 par la relative sécheresse des plumes de pollution.
Bref, on en reste à peu près où on en était; la pollution par les microparticules reste un facteur de refroidissement du climat, juste un peu moins fort qu'on le pensait précédemment.

Toll, V., Christensen, M., Quaas, J., & Bellouin, N. (2019). Weak average liquid-cloud-water response to anthropogenic aerosols. Nature, 572(7767), 51-55. Retrieved from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31367029. doi:https://doi.org/10.1038/s41586-019-1423-9


08.08.2019, Nature 272, 7768
-194-198 ÉCOLOGIE, CONSERVATION, ZOOLOGIE, les biologistes.

Estimation globale de l'abondance des nématodes.
On entend toutes sortes de chiffres concernant la proportion des êtres vivants qui disparaissent. C'est important, j'en sais peu, je vais veiller à en apprendre davantage. Une chose est sûre : pour la plupart des espèces, on ne sait pas grand-chose. La présente étude n'apporte pas de réponse, mais servira de base pour suivre l'évolution future d'un groupe d'espèce important et typique de notre ignorance actuelle. Il s'agit des nématodes, des vers dont la plupart sont microscopiques, mais qui jouent un rôle essentiel dans la dynamique des sols. Les auteurs les ont comptés en 6759 endroits du monde. Le résultat est que leur masse totale (0.3Gt) représente à peu près 60% de la masse des humains. De la carte de densité ainsi établie, il ressort que c'est au grand-Nord  (Alaska, Canada, Sibérie) qu'ils sont le plus abondants.
Autre conclusion à tirer : si l'on a d'assez bonnes idées sur la façon dont le climat évolue, on répond de manière fort lacunaire à la même question concernant la biodiversité. Ce ne sont pas les 70 auteurs de cet article qui diront le contraire. Je cite souvent l'observation que, quand j'étais jeune, le par brise de la voiture était rapidement souillé d'insectes alors qu'aujourd'hui, les vitres restent pratiquement propres. Je vais essayer d'y voir plus clair: voir § ci-dessous.

van den Hoogen, J., Geisen, S., Routh, D., Ferris, H., Traunspurger, W., Wardle, D. A., . . . Crowther, T. W. (2019). Soil nematode abundance and functional group composition at a global scale. Nature, 572(7768), 194-198. Retrieved from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31341281. doi:10.1038/s41586-019-1418-6

ÉCOLOGIE, CONSERVATION, ZOOLOGIE, INSECTES. Tous
Suite du § précédent. Un article de PloS ONE que m'indique Ted concernant la  diminution des insectes en Allemangne.
Durant 27 ans, à l'aide de la trappe standard utilisée par les entomologistes, ce consortium de laboratoires récolte les insectes volants près du sol (1m) dans 63 sites protégés d'Allemagne. Conclusion: durant cette période, la biomasse des insectes capturés à diminué de ¾ en moyenne annuelle et 82% à mi-été.

Hallmann, C. A., Sorg, M., Jongejans, E., Siepel, H., Hofland, N., Schwan, H., . . . de Kroon, H. (2017). More than 75 percent decline over 27 years in total flying insect biomass in protected areas. PloS ONE, 12(10), e0185809. Retrieved from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29045418. doi:10.1371/journal.pone.0185809

15.08.2019, Nature 272, 7769
-373 – 377.  ÉNEGIE, CO2, 1.5°C, GPclim, com. sci.

Les émissions par les infrastructures énergétiques existantes, en construction ou planifiées ne permettront pas d'atteindre le but des 1.5°C. Tong et al.
Nous l'avons vu le mois passé, la quantité de CO2 que l'on pourrait  encore déverser dans l'atmosphère pour avoir 50% de chance de tenir les 1.5°C est de 480 Gt. Pour 2°C ce serait 1400 Gt. Au rythme actuel de 30 Gt/années, il reste peu de temps.
Dans le présent article, les auteurs considèrent les centrales thermiques existantes, celles en construction et celles dont la construction est décidée. En tenant compte des pratiques actuelles d'exploitation, ils déterminent la quantité de CO2 que ces centrales nous promettent.
Centrales déjà construites. 660 Gt
Centrales en construction ou proposées : 190Gt.
Conclusion : À elle seule, l'exploitation standard des centrales existantes nous fera probablement dépasser les 1.5°. Pour tenir les promesses de Paris, il faut fermer beaucoup de centrales existantes et ne pas en construire de nouvelles. On voit du même coup combien la recherche de nouvelles sources de gaz et d'hydrocarbure est criminelle.
La figure ci-dessous indique la production annuelle que l'on peut attendre des centrales actuellement existantes (foncées) et de celles actuellement prévues (clair). À gauche, les données se rapportent au type d'utilisation, à droite aux pays producteurs.
On note que, dans ce scénario, la Chine compte pour 41% ; les USA pour 9% et l'EU pour 7%. Aïe, ils sont fous les Chinois ; c'est eux qu'il faut secouer.


Tong, D., Zhang, Q., Zheng, Y., Caldeira, K., Shearer, C., Hong, C., . . . Davis, S. J. (2019). Committed emissions from existing energy infrastructure jeopardize 1.5 degrees C climate target. Nature, 572(7769), 373-377. Retrieved from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31261374. doi:10.1038/s41586-019-1364-3

22.08.2019, Nature 272, 7770
-442-3, 520-523. INCENDIE, FORÊT BORÉALE, CO2. GPclim, com. sci.

L'augmentation des incendies de forêts boréales compromet leur capacité à fixer le CO2.
On parle beaucoup des incendies dans les forêts tropicales et de la folle politique du président du Brésil Bolsonaro. Le présent article montre que les incendies dans les forêts boréales sont peut-être encore plus menaçants.
Le sol des forêts « minérales » dans les zones tropicales ou tempérées est relativement pauvre. La matière organique se trouve plutôt dans les arbres que dans le sol. Le sol des forêts boréales humides (Canada, Sibérie) se rapproche généralement de celui d'une tourbière riche en matière organique. Globalement, il contient 30 -40% du carbone terrestre. La productivité de ces forêts tient au cycle des incendies qui est typiquement de 70 – 200 ans (temps de retour du feu t.) Normalement ces incendies brûlent la végétation, mais n'attaquent pas profondément la masse du carbone enfoui (hérité). Toutefois, lorsque les incendies se succèdent trop rapidement le carbone du sol est également emporté par l'incendie.
Dans le présent article, les auteurs analysent – en particulier par datation du carbone radioactif - l'histoire détaillée du sol de la forêt tropicale façonnée par les incendies. Ils concluent que si les incendies se développent comme on l'a vu ces dernières années, non seulement cette forêt ne sera plus un puits de carbone comme elle le fut jusqu'ici, mais l'immense quantité de carbone enfouie dans le sol de la forêt contribuera à augmenter le déversement du CO2 dans l'atmosphère.
Selon les données du GIEC que Markus Noll compile attentivement, l'élévation de la température est encore proportionnelle à l'élévation de la concentration de CO2. Ceci veut dire que, pour le moment, on n'observe pas de rétroaction non linéaire qui indiquerait que le système est en train de devenir chaotique. Pour combien de temps encore ?

Walker, X. J., Baltzer, J. L., Cumming, S. G., Day, N. J., Ebert, C., Goetz, S., . . . Mack, M. C. (2019). Increasing wildfires threaten historic carbon sink of boreal forest soils. Nature, 572(7770), 520-523. Retrieved from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31435055. doi:10.1038/s41586-019-1474-y

29.08.2019, Nature 272, 7771
-565. RECONNAISSANCE FACIALE, POLITIQUE. IA. Tous

Il faut interdire l'usage de la reconnaissance faciale tant qu'elle n'est pas régulée. Kate Crawford, éditoriale
Résumé : ces outils sont dangereux quand ils ne marchent pas et néfastes quand ils marchent.
-442-3, 520-523. INCENDIE, FORÊT TROPICALE, CO2. GPclim, com. sci.
Les incendies de la forêt amazonienne jusqu'en août de cette année.